Ó thús na paindéime, tá ról ríthábhachtach ag tástáil dhiagnóiseach maidir le scaipeadh SARS-CoV-2 a rialú, an víreas is cúis leCOVID 19.Tástálacha antigen tapaa dhéantar sa bhaile nó i suíomh cliniciúil torthaí a sholáthar i 15 nóiméad nó níos lú.Dá luaithe a dhéantar diagnóis ar dhuine, is luaithe is féidir leo aire leighis a lorg agus iad féin a leithlisiú ó dhaoine eile.Ach nuair a bhíonn leaganacha nua den víreas le feiceáil, ní fhéadfaidh na tástálacha sin na leaganacha sin a bhrath.
Tá formhór na dtástálacha antaiginí gasta deartha chun an próitéin SARS-CoV-2 nucleocapsid nó N-próitéin a bhrath.Faightear an próitéin seo go flúirseach i gcáithníní víreasacha agus i ndaoine ionfhabhtaithe.Trealamh tástála mears de ghnáth bíonn dhá antashubstaint dhiagnóiseacha éagsúla ann a cheanglaíonn codanna éagsúla den phróitéin N.Nuair a cheanglaíonn antashubstaint leis an próitéin N i sampla, léirítear líne dhaite nó comhartha eile ar an trealamh tástála, rud a léiríonn ionfhabhtú.
Tá Próitéin N comhdhéanta de 419 aonad struchtúrach aimínaigéad.Is féidir aon cheann acu a chur in ionad aimínaigéad eile trí shóchán.Grúpa taighde faoi stiúir Ph.D.Chuir Philip Frank agus Eric Ortlund ó Ollscoil Emory amach imscrúdú a dhéanamh ar an gcaoi a dtéann an t-athrú aimínaigéad aonair seo i bhfeidhm ar fheidhmíocht tástála tapa antaiginí.D’úsáid siad teicníocht ar a dtugtar scanadh domhainshócháin chun measúnú comhuaineach a dhéanamh ar an tionchar a bhíonn ag gach sóchán i bpróitéin N den víreas ar an gceangal ar antasubstaint dhiagnóiseach.Foilsíodh a dtorthaí i Cell an 15 Meán Fómhair 2022.
Chruthaigh na taighdeoirí leabharlann chuimsitheach de bheagnach 8,000 sóchán próitéin N.Is ionann na leaganacha seo agus níos mó ná 99.5% de na sócháin féideartha go léir.Rinne siad measúnú ansin ar an gcaoi a ndearna gach malairt idirghníomhú le 17 n-antasubstaint dhiagnóiseach a úsáideadh i 11 thástáil thapa antaiginí a bhí ar fáil go tráchtála, lena n-áirítearfeisteáin baile.
Rinne an fhoireann measúnú ar na sócháin N-próitéin a mbíonn tionchar acu ar aithint antashubstainte.Bunaithe ar an bhfaisnéis seo, chruthaigh siad “próifíl sóchán éalaithe” do gach antasubstaint dhiagnóiseach.Aithníonn an phróifíl seo sócháin ar leith sa phróitéin N a d’fhéadfadh cur isteach ar chumas an antashubstainte ceangal a dhéanamh dá sprioc.Léiríodh san anailís go n-aithníonn agus go gceanglaíonn na hantasubstaintí a úsáideadh i dtástálacha tapa an lae inniu gach leagan de SARS-CoV-2 san am atá caite agus san am i láthair ar ábhar imní agus imní iad.
Cé go n-aithníonn roinnt antasubstaintí diagnóiseacha an réigiún céanna den phróitéin N, fuair na taighdeoirí amach go bhfuil síniú uathúil sócháin éalaithe ag gach antasubstaint.De réir mar a leanann an víreas SARS-CoV-2 ar aghaidh ag mutadh agus ag giniúint leaganacha nua, is féidir na sonraí seo a úsáid chun antasubstaintí a d’fhéadfadh a bheith riachtanach a athmheasúnú a mharcáil.
“Tá sainaithint chruinn agus éifeachtach daoine aonair ionfhabhtaithe fós ina straitéis ríthábhachtach do mhaolú COVID-19, agus soláthraíonn ár staidéar faisnéis faoi shócháin SARS-CoV-2 amach anseo a d’fhéadfadh cur isteach ar bhrath,” a dúirt Ortlund.“Ceadaíonn na torthaí atá leagtha amach anseo dúinn oiriúnú go tapa don víreas seo de réir mar a leanann leaganacha nua ag teacht chun cinn, rud a chuireann impleachtaí láithreacha cliniciúla agus sláinte poiblí i láthair.”
Cúlra: Aimsíonn Scan Deep Mutation sócháin éalaithe sa nucleocapsid SARS-CoV-2 ag baint úsáide as tástálacha tapa antaiginí atá ar fáil faoi láthair.Frank F., Kin MM, Rao A., Bassit L., Liu H, Bowers HB, Patel AB, Kato ML, Sullivan JA, Greenleaf M., Piantadosi A., Lam VA, Hudson VH, Ortlund EA cill.2022 Meán Fómhair 15;185(19):3603-3616.e13.An Aireacht Intíre: 10.1016/j.cell.2022.08.010.29 Lúnasa, 2022 PMID: 36084631.
Maoiniú: An Institiúid Náisiúnta um Íomháú Bithleighis agus Bithinnealtóireacht NIH (NIBIB), An Institiúid Náisiúnta um Dhiaibéiteas, Galair Dhíleácha agus Duán (NIDDK) agus an Institiúid Náisiúnta um Ailléirge agus Galair Thógálacha (NIAID), Cumann Croí Mheiriceá.
Is nuashonrú seachtainiúil é NIH Research Matters ar phríomhthorthaí taighde NIH arna athbhreithniú ag saineolaithe NIH.Tá sé foilsithe ag Oifig Cumarsáide agus Gnóthaí Poiblí Stiúrthóir na nInstitiúidí Náisiúnta Sláinte.